Brasil, 1977. Marcelo, especialista em tecnologia, está em fuga e chega ao Recife na semana do Carnaval, na esperança de reencontrar o filho. Mas no meio da comunidade vibrante que o recebe, vê-se envolvido numa atmosfera de paranóia e perigo. Construído como um puzzle de intriga e informação, O Agente Secreto mostra como a verdade é escondida e a memória colectiva reconfigurada nos regimes opressivos.